Chương trình chia làm 2 giai đoạn: 2021-2025 và 2025-2030.
Mục tiêu:
Cụ thể hoá các quan điểm, đường lối, định hướng theo Nghị quyết Đại hội XIII của Đảng; Chương trình hành động của Chính phủ, của Bộ Nội vụ thực hiện Nghị quyết Đại hội XIII, Chiến lược phát triển kinh tế - xã hội giai đoạn 2021-2030 và phương hướng, nhiệm vụ phát triển kinh tế - xã hội giai đoạn 2021-2025 có liên quan đến chức năng, nhiệm vụ của Ban Tôn giáo Chính phủ và Ngành Quản lý nhà nước về tín ngưỡng, tôn giáo làm căn cứ để Ban Chấp hành Đảng bộ, Lãnh đạo Ban Tôn giáo Chính phủ, cấp uỷ, lãnh đạo các Ban/Phòng Tôn giáo (Sở Nội vụ), các Ban Dân tộc - Tôn giáo, Ban Tôn giáo và Dân tộc các tỉnh, thành phố tập trung tham mưu và lãnh đạo, chỉ đạo tổ chức thực hiện có hiệu quả công tác quản lý nhà nước về tín ngưỡng, tôn giáo....