Ngày 9-9-1964 chiến cuộc nồi da xáo thịt rất khốc liệt. Chính phủ Việt Nam Cộng Hòa yêu cầu Hội Thánh tạo dấu hiệu tôn giáo trên nóc Thánh Thất, Điện Thờ để tránh sự nhầm lẫn khi oanh tạc.
Trong chiến tranh chính phủ Việt Nam Cộng Hòa vẫn quan tâm bảo vệ tôn giáo.
